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Omni5芯片为新一代GWAS研究铺路
发布日期:2011-8-10  浏览次数:1071 

  Omni芯片家族自2009年上市以来,已经提供了一系列灵活的芯片,它们带来了精选自国际HapMap计划和千人基因组计划的常见和稀有变异。此款芯片为Omni芯片家族的旗舰产品,Omni5芯片为新一代GWAS研究铺路。

  牛津大学Wellcome Trust人类遗传学中心的Robert Turner教授认为,基于HapMap的全基因组关联研究(GWAS)向复杂疾病研究迈出了巨大的一步,但也有更多有待发现。他谈到:“Omni5更广地覆盖了常见和稀有变异,为科学界提供了一个更深度挖掘疾病遗传机理的工具。我们还注意了Omni5的定制灵活性,这样,我们就能够用我们自己的测序实验所发现的变异体来加强传统的GWAS研究。”

  4个样品的Omni5芯片特有超过430万个标记物/样品。此外,Omni5还能容纳最多50万个定制标记物,为研究提供了灵活性。此芯片能够靶定次要等位基因频率(MAF)低至1%的变异,显著扩展了稀有变异的数量。研究人员可高效可靠地研究稀有变异,以阐明复杂疾病背后的遗传机制,这让Omni5成为GWAS研究的强大工具。

  Omni5代表了Illumina Omni路线图上的一项重大成就,此路线图为研究人员提供了一系列灵活的芯片,特有来自千人基因组计划的新颖、常见和稀有变异。除了提供人类变异(MAF低至1%)的密集覆盖,Omni5上的内容还覆盖了基因组中与疾病关联的高价值区域,包括基因区域、MHC区域和非同义SNP。芯片还特有来自千人基因组计划的近5000个插入缺失和多碱基替换标记物,能帮助研究人员阐明结构变异如何影响性状和疾病。

  Omni5芯片可容纳4个样品,每周的样品通量可达460个。它可利用HiScan或iScan系统来扫描,并与Illumina的自动化方案完全兼容。

  当然,若是您刚着手开展GWAS研究,也不必非从Omni5入手。Illumina的为您提供了多种选择(如下)。路线图的多条路径提供了时间和预算的灵活性,以协助研究人员高效实现他们的研究目标。它能够让研究人员选择路径,以便带来与他们独特研究最相关的内容。

Illumina 2010产品路线图

 
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